清潩河流域除天然降水外，无生态径流，天然径流匮乏，入河水源主要由城镇生活污水、工业废水构成。主要监测断面显示水质为劣Ⅴ类。

由于清潩河沿岸水土流失，生活类污染物及由点源超标排放的悬浮物入河并在河道内沉降、富集，导致河道内大量污染物形成淤泥淤积，而淤积污泥作为内源不仅会向水体不断释放污染物，加剧水质污染，还会使河床底部严重厌氧化，从而导致底栖生物死亡，河床发黑发臭，河道水生态系统破坏，水体自净能力丧失。

此外，清潩河干流上橡胶坝的修建使得水流速度变慢，坝前污泥淤积严重，其厌氧腐化过程所产生的气体聚集到一定程度，则将淤积层成片掀起，在橡胶坝阻挡区形成坝区淤泥上浮现象，并将水质搅浑，导致水质严重恶化。因此，要彻底改善清潩河水体质量，除了严控点源及面源的排放外，还需对河道内源进行综合整治，采取清淤、原位修复等措施重建河道生态系统，恢复河流自净能力。

由于缺乏合理的垃圾处置场所及有效的监督管理机制，清潩河城区段上游城乡结合部及农村部分地区向河道倾倒垃圾问题突出，导致清潩河沿岸存在无组织倾倒和堆存的垃圾，这些垃圾会随降水的地表径流排入河内，造成水体污染。此外，河岸植被无序，杂草丛生，由岸至水的生物结构尚未形成科学合理的系统，物种间关联性不强，无法对排入河道内的污水起到预净化作用，且河岸环境景观也较差。

加大产业结构调整力度，积极推进流域产业结构调整升级，按照控制规模、逐步减产、完全退出“三步走”的原则，制订出淘汰清潩河流域重污染行业的实施方案，逐步淘汰落后产能。同时，鼓励发展无污染、节水和资源综合利用的项目。

加快推进城镇污水处理厂配套管网和城镇污水处理厂等市政基础设施建设工程。对分区开发不衔接、排污设施不配套形成的市政污水排放口，通过加快完善区域污水管网建设，实现污水管网有效衔接和覆盖。

推进雨污分流和现有合流管网系统改造。加强雨水口的综合整治力度，在查清雨污混流排水口污水来源的基础上，对因排污管网不完善造成雨污混流的，加快完善管网建设，实施雨污分流改造。

清理河道水面漂浮物和沿岸垃圾，清除河道内排污口、水闸等附属设施周边区域的废物、堆积物，彻底消除影响水环境的各种污染物，改善清潩河沿岸的景观面貌; 加强对河道日常巡视和管理，保持河面无垃圾漂浮物，沿岸垃圾及时收运，实现河面无漂浮物、河岸无垃圾;认真履行河道整治执法职责，依法依规拆除影响城市行洪、截污治污、河道景观改造的违法违章建设，完善河道环境卫生长效管理机制。

加强清潩河流域生态建设和保护。在清潩河流域有条件的地区，因地制宜地建设人工湿地或生物浮床等生态工程，有选择地种植水生、陆生植物，一方面打造河道生态景观，提高水环境承载力，同时能够对入河污水起到深度净化的作用，进一步削减入河污染负荷。

加强重点污染源监管，针对清潩河流域的重点污染源按照“一企一档”的原则建立规范的动态监管档案; 加强对重点污染源在线监测设备运行状况的监督与检查，同时开展定期和不定期的监督性监测，一旦发现超标，立即停产并限期整改。